| No. | タイトル ⇒YouTube |
| 26 |  ポケモンピンボール ルビー＆サファイア ⇒ / ポケモン/任天堂 【発売】2003/08/01 【売上】40.6万本 |
| 27 | 遊戯王デュエルモンスターズ5 エキスパート1 ⇒ / コナミ 【発売】2001/07/05 【売上】39.9万本 |
| 28 | 伝説のスタフィー2 ⇒ / 任天堂 【発売】2003/09/05 【売上】39.6万本 |
| 29 | MOTHER3 ⇒ / 任天堂 【発売】2006/04/20 【売上】36.8万本 |
| 30 | ファミコンミニ スーパーマリオブラザーズ2 ⇒ / 任天堂 【発売】2004/08/10 【売上】36.5万本 |
| 31 | とっとこハム太郎3 ラブラブ大冒険でちゅ ⇒ / 任天堂 【発売】2002/05/31 【売上】35.1万本 |
| 32 | スライムもりもりドラゴンクエスト 衝撃のしっぽ団 ⇒ / スクウェア･エニックス 【発売】2003/11/14 【売上】34.6万本 |
| 33 | ファイアーエムブレム 封印の剣 ⇒ / 任天堂 【発売】2002/03/29 【売上】34.5万本 |
| 34 | キングダムハーツ チェインオブメモリーズ ⇒ / スクウェア･エニックス 【発売】2004/11/11 【売上】34.2万本 |
| 35 | 黄金の太陽～開かれし封印～ ⇒ / 任天堂 【発売】2001/08/01 【売上】33.8万本 |
| 36 | F-ZERO FOR GAMEBOY ADVANCE ⇒ / 任天堂 【発売】2001/03/21 【売上】33.4万本 |
| 37 | スーパーロボット大戦A ⇒ / バンプレスト 【発売】2001/09/21 【売上】31.0万本 |
| 38 | ゼルダの伝説 神々のトライフォース＆4つの剣 ⇒ / 任天堂 【発売】2003/03/14 【売上】29.3万本 |
| 39 | とっとこハム太郎4 にじいろ大行進でちゅ ⇒ / 任天堂 【発売】2003/05/23 【売上】29.3万本 |
| 40 | スーパーロボット大戦R ⇒ / バンプレスト 【発売】2006/07/27 【売上】28.5万本 |
| 41 | タクティクスオウガ外伝 The Knight of Lodis ⇒ / 任天堂 【発売】2001/06/21 【売上】28.2万本 |
| 42 | ファイナルファンタジーVI アドバンス ⇒ / スクウェア･エニックス 【発売】2006/11/30 【売上】28.1万本 |
| 43 | MOTHER1＋2 ⇒ / 任天堂 【発売】2003/06/20 【売上】27.8万本 |
| 44 | 新約 聖剣伝説 ⇒ / スクウェア･エニックス 【発売】2003/08/29 【売上】27.7万本 |
| 45 | ファイナルファンタジーI･II アドバンス ⇒ / スクウェア･エニックス 【発売】2004/07/29 【売上】26.9万本 |
| 46 | リズム天国 ⇒ / 任天堂 【発売】2006/08/03 【売上】26.8万本 |
| 47 | ファイアーエムブレム 烈火の剣 ⇒ / 任天堂 【発売】2003/04/25 【売上】26.5万本 |
| 48 | くるくるくるりん ⇒ / 任天堂 【発売】2001/03/21 【売上】26.5万本 |
| 49 | パワプロクンポケット6 ⇒ / コナミ 【発売】2003/12/04 【売上】26.5万本 |
| 50 | 遊戯王デュエルモンスターズ6 エキスパート2 ⇒ / コナミ 【発売】2001/12/20 【売上】26.4万本 |
